부가세 납부 방법 - 홈택스 납부서 조회·카드납부 확인 기준

부가세 신고를 끝냈는데도 마지막에 한 번 더 막히는 부분이 있습니다. 바로 납부입니다.

신고서 제출까지는 했는데 납부서를 어디서 다시 보는지, 카드로 내도 되는지,
카드 수수료는 누가 부담하는지 헷갈리는 사장님이 많습니다.

부가세는 신고만 하고 끝나는 세금이 아닙니다.
납부할 세액이 있다면 신고기한 안에 실제 납부까지 확인해야 합니다.

특히 홈택스에서 신고서를 제출한 뒤 접수증만 보고 창을 닫으면 납부서를 다시 찾느라 시간을 쓰는 경우가 있습니다.

아래에서는 개인사업자와 작은 가게 사장님이 부가세 신고 후 확인해야 할 홈택스 납부서 조회 방법,
계좌이체 납부, 신용카드 납부, 인터넷지로 확인 기준, 납부내역 확인 방법을 순서대로 정리합니다.

부가세 납부 방법 홈택스 납부서 조회 카드납부 기준

 

사장님 노트 핵심 정리

부가세 납부는 신고서 제출 후 납부할 세액과 납부기한을 다시 확인하는 단계입니다. 홈택스에서 납부서를 조회한 뒤 계좌이체, 신용카드, 간편결제, 인터넷지로, 은행 방문납부 중 사업장 상황에 맞는 방법을 선택할 수 있습니다.

핵심 요약표

구분	확인할 내용
납부 대상	부가세 신고 결과 납부할 세액이 있는 사업자
기본 확인 경로	홈택스 → 납부·고지·환급 → 세금납부 → 납부할 세액 조회/납부
신고 후 납부서 확인	부가가치세 신고 메뉴의 신고내역 조회 또는 접수증·납부서 출력 메뉴 확인
납부 방법	계좌이체, 신용카드, 간편결제, 인터넷지로, 은행 방문납부
카드납부 주의점	납부대행수수료가 납세자 부담으로 붙을 수 있음
납부 후 확인	홈택스 또는 손택스 납부내역 조회, 납부내역증명 확인
문의처	국세상담센터 126, 관할 세무서, 금융결제원 인터넷지로 상담센터

이 글에서 확인할 내용

부가세 납부 전에는 세 가지를 나눠서 봐야 합니다.

• 신고가 정상 접수되었는지 확인합니다.
• 납부할 세액과 납부기한을 확인합니다.
• 어떤 방식으로 납부할지 정합니다.

부가세 납부 방법은 단순히 “홈택스에서 내면 된다”로 끝내기 어렵습니다. 신고 직후 화면에서 바로 납부하는 경우, 나중에 납부서를 다시 조회하는 경우, 예정고지 세액을 납부하는 경우, 카드로 납부하는 경우가 각각 다릅니다. 사업장 상황에 따라 보여지는 메뉴와 필요한 확인 항목이 달라질 수 있습니다.

부가세 납부 대상자와 적용 조건

일반과세자 개인사업자

개인 일반과세자는 일반적으로 1년에 두 번 부가세 확정신고를 합니다. 제1기 과세기간은 1월 1일부터 6월 30일까지이며 신고·납부기간은 7월 1일부터 7월 25일까지입니다. 제2기 과세기간은 7월 1일부터 12월 31일까지이며 신고·납부기간은 다음 해 1월 1일부터 1월 25일까지입니다.

개인사업자는 법인사업자처럼 매 분기마다 직접 신고하는 방식과 다르게, 예정고지 대상이 되는 경우가 있습니다. 예정고지는 국세청이 직전 과세기간 납부세액 등을 기준으로 고지하는 중간 납부 성격입니다. 예정고지 세액은 다음 확정신고 때 기납부세액으로 차감될 수 있습니다.

간이과세자

간이과세자는 원칙적으로 1년을 과세기간으로 하여 다음 해 1월 25일까지 신고·납부합니다. 다만 7월 1일 기준으로 간이과세자에서 일반과세자로 유형이 전환되었거나, 예정부과기간에 세금계산서를 발급한 간이과세자는 1월 1일부터 6월 30일까지의 실적을 기준으로 7월 25일까지 신고·납부해야 하는 경우가 있습니다.

간이과세자는 납부세액이 없거나 적게 나오는 경우도 있지만, 신고 자체가 필요 없는 것으로 오해하면 안 됩니다. 납부할 세액이 0원인지, 납부할 금액이 있는지는 홈택스 신고 결과와 납부서에서 확인해야 합니다.

폐업한 사업자

폐업한 경우에는 일반적인 1월·7월 신고기간만 보면 놓칠 수 있습니다. 폐업자의 부가세 신고·납부는 폐업일이 속하는 달의 다음 달 25일까지가 기준입니다. 예를 들어 5월에 폐업했다면 다음 달 25일까지 폐업일까지의 실적을 신고·납부해야 합니다.

폐업신고를 했다고 해서 부가세 신고와 납부가 자동으로 끝나는 것은 아닙니다. 폐업 후 남은 매출, 재고, 세금계산서, 카드매출, 배달앱 정산 내역이 있다면 신고 전 확인이 필요합니다.

부가세 납부 전 먼저 볼 기준

신고 접수 상태부터 확인합니다

부가세를 납부하려면 먼저 신고가 정상 접수되어야 합니다. 홈택스에서 신고서를 작성했더라도 마지막 제출 단계가 끝나지 않았거나 오류가 있으면 납부서 확인이 제대로 되지 않을 수 있습니다.

홈택스 또는 손택스에서 부가세 신고를 마친 뒤에는 접수증을 확인하고, 신고내역 조회 메뉴에서 제출한 신고서와 납부서를 확인하는 흐름으로 보는 것이 안전합니다.

확인 항목	보는 이유
접수결과	신고가 정상 접수되었는지 확인
과세기간	1기, 2기, 간이과세자 연간 신고 구분 확인
사업자등록번호	개인 명의와 사업장 선택 오류 방지
납부할 세액	실제 납부해야 할 금액 확인
납부기한	신고기한과 납부기한 확인
납부서 출력 여부	은행 방문 또는 보관용으로 필요할 수 있음

납부서와 접수증은 역할이 다릅니다

접수증은 신고가 접수되었다는 확인에 가깝습니다. 납부서는 납부할 세액, 세목, 납부기한, 전자납부번호 등 납부에 필요한 정보를 확인하는 자료입니다.

신고 접수증만 저장해 두고 납부를 놓치는 경우가 있습니다. 납부할 세액이 있는 신고라면 접수증 확인 후 납부서까지 확인하는 것이 좋습니다.

홈택스에서 부가세 납부서 조회하는 방법

방법 1. 신고 직후 납부서 확인

부가세 신고를 홈택스에서 마친 직후라면 신고 완료 화면이나 신고내역 조회 화면에서 납부서를 확인할 수 있습니다.

신고 직후 확인 흐름

1. 홈택스 접속
2. 로그인
3. 세금신고 메뉴 선택
4. 부가가치세 신고 메뉴 선택
5. 신고내역 조회 또는 접수증·납부서 출력 메뉴 확인
6. 조회 기간과 사업자 정보를 확인
7. 신고내역에서 접수증 또는 납부서 확인
8. 납부할 세액이 있으면 납부하기 또는 납부서 출력 선택

메뉴명은 홈택스 개편이나 접속 화면에 따라 조금 다르게 보일 수 있습니다. 핵심은 “부가가치세 신고내역 조회”, “접수증”, “납부서”라는 단어를 찾는 것입니다.

방법 2. 납부할 세액 조회/납부 메뉴에서 확인

신고가 정상 접수된 뒤 나중에 다시 납부하려면 홈택스의 납부 메뉴에서 확인할 수 있습니다.

납부 메뉴 확인 흐름

1. 홈택스 접속
2. 로그인
3. 납부·고지·환급 선택
4. 세금납부 선택
5. 납부할 세액 조회/납부 선택
6. 납부할 세금 목록 확인
7. 부가가치세 항목 선택
8. 납부하기 선택
9. 계좌이체, 신용카드, 간편결제 중 선택

납부할 세액 조회 화면에 보이는 금액은 신고·고지 정보와 연결되어 표시됩니다. 조회가 안 된다면 신고가 정상 접수되었는지, 사업장 선택이 맞는지, 조회 기간이 맞는지부터 확인해야 합니다.

방법 3. 손택스에서 확인

모바일 홈택스인 손택스에서도 납부할 세액과 납부내역을 확인할 수 있습니다. 다만 일부 서비스는 인증 방식에 따라 제한될 수 있으므로, 사업자 업무는 공동인증서·금융인증서·간편인증 등 본인 확인 수단을 준비해 두는 것이 좋습니다.

손택스에서는 전체 메뉴에서 신고납부, 국세납부, 납부할 세액 조회 또는 납부내역 조회 항목을 찾아 확인합니다. 화면이 작기 때문에 금액과 세목을 선택할 때 부가가치세가 맞는지 한 번 더 확인하는 것이 좋습니다.

부가세 납부 방법

1. 홈택스 계좌이체 납부

가장 기본적인 방법은 홈택스에서 납부할 세액을 조회한 뒤 계좌이체로 납부하는 방식입니다. 사업용계좌 또는 개인 명의 계좌에서 출금이 가능하지만, 사업장 회계 관리를 생각하면 사업용으로 관리하는 계좌를 사용하는 편이 정리에 유리합니다.

확인 항목	내용
출금 계좌 잔액	납부세액보다 잔액이 충분한지 확인
이체 한도	인터넷뱅킹·공동인증 한도 확인
납부기한	마감일에는 접속 지연 가능성이 있음
사업자 선택	여러 사업장이 있는 경우 사업자번호 확인
세목	부가가치세가 맞는지 확인

2. 홈택스 신용카드 납부

부가세는 신용카드로도 납부할 수 있습니다. 국세청 안내 기준으로 신용카드 납부는 모든 세목이 대상이며, 홈택스와 인터넷지로, 금융기관 CD/ATM, 세무서 카드 단말기 등을 통해 납부할 수 있습니다.

다만 카드납부는 납부대행수수료가 붙을 수 있습니다. 국세청 신용카드납부 안내에서는 납부대행수수료가 납세자 부담이라고 안내합니다. 이 수수료는 세금 자체가 아니라 카드납부 대행에 따른 비용이므로, 계좌이체 납부와 비교해서 선택하는 것이 좋습니다.

카드납부 전 확인할 점

카드납부는 편리하지만 납부대행수수료와 카드 한도, 결제일 부담을 함께 봐야 합니다. 부가세 자체를 줄이는 방법이 아니라 납부수단을 카드로 선택하는 것입니다.

확인 항목	왜 확인해야 하나요?
납부세액	카드 한도와 비교해야 함
납부대행수수료	납세자가 부담할 수 있음
카드 한도	세금 납부액이 한도를 초과할 수 있음
할부 가능 여부	카드사·기간별로 다를 수 있음
승인 후 취소 가능성	세금 납부는 일반 쇼핑 결제와 다르게 처리될 수 있음
납부 완료 여부	승인 문자만 보고 끝내지 말고 납부내역 조회 필요

3. 인터넷지로 납부

인터넷지로에서도 국세 납부가 가능합니다. 2026년 기준으로 카드로택스 별도 사이트는 종료 안내가 있었고, 카드납부 관련 접속은 인터넷지로 중심으로 확인하는 흐름이 안전합니다.

인터넷지로 이용 흐름

1. 인터넷지로 접속
2. 로그인
3. 국세 선택
4. 조회납부 또는 자진납부 선택
5. 납부할 세금 확인
6. 결제수단 선택
7. 납부 완료 후 결과 확인

인터넷지로에서 조회납부가 안 되는 경우에는 홈택스 신고내역과 납부서를 먼저 확인하는 것이 좋습니다. 납부번호나 세목을 직접 입력하는 자진납부는 입력 오류가 생기면 확인이 번거로울 수 있으므로, 납부서 내용을 정확히 보고 진행해야 합니다.

4. 은행 방문 납부

온라인 납부가 어렵다면 납부서를 출력해 은행이나 우체국 등 금융기관에서 납부할 수 있습니다. 방문 납부를 할 때는 납부서에 적힌 세목, 납부번호, 세무서 코드, 납부세액, 납부기한을 확인해야 합니다.

상황	확인할 점
온라인 인증이 어려운 경우	납부서 출력 후 은행 방문
고령 가족이 대신 확인하는 경우	사업자 본인 정보와 납부서 필요
카드 또는 계좌 오류가 반복되는 경우	관할 세무서 또는 금융기관 문의
마감일 접속 지연이 있는 경우	가능한 오전 또는 전날 처리 권장

카드납부할 때 자주 헷갈리는 부분

카드로 내면 수수료가 붙나요?

국세 신용카드 납부는 납부대행수수료가 납세자 부담으로 붙을 수 있습니다. 수수료는 카드 종류와 납부 방식에 따라 달라질 수 있으므로, 결제 전 화면에서 표시되는 금액을 확인해야 합니다.

카드 승인 문자가 오면 납부가 끝난 건가요?

카드 승인 문자는 결제가 진행되었다는 정보입니다. 세금 납부가 정상 반영되었는지는 홈택스 또는 손택스의 납부내역 조회에서 다시 확인하는 것이 안전합니다.

카드납부 후 납부확인서는 어디서 보나요?

홈택스 또는 손택스에서 납부내역 조회를 통해 납부세액, 납부일자, 세목, 전자납부번호 등을 확인할 수 있습니다. 필요한 경우 납부내역증명, 납세사실증명 등 민원증명 메뉴에서 증명서 발급을 확인할 수 있습니다.

부가세 납부 후 확인할 것

부가세는 납부 버튼을 누른 뒤에도 한 번 더 확인하는 습관이 필요합니다.

확인 항목	확인 이유
납부일자	납부기한 안에 처리되었는지 확인
세목	부가가치세로 납부되었는지 확인
귀속연도·과세기간	다른 기간 세금과 혼동 방지
납부세액	신고서 납부세액과 일치하는지 확인
전자납부번호	문의나 증명 발급 때 필요할 수 있음
납부확인서	제출 또는 보관이 필요한 경우 출력

작은 가게에서는 카드매출, 배달앱 정산, 현금영수증, 세금계산서가 여러 경로로 섞입니다. 부가세 신고 후 납부까지 끝냈다면 납부확인서와 신고서 접수증을 같은 폴더에 보관해 두면 다음 신고 때 확인하기 좋습니다.

납부서 조회가 안 될 때 확인할 부분

사업장 선택이 맞는지 확인합니다

개인사업자가 여러 사업장을 가지고 있거나, 개인 아이디로 로그인한 뒤 사업장 전환을 하지 않은 경우 납부할 세액이 보이지 않을 수 있습니다. 홈택스 상단 또는 사업장 선택 메뉴에서 현재 선택된 사업자등록번호를 확인합니다.

신고가 정상 제출되었는지 확인합니다

신고서를 작성만 하고 제출하지 않은 경우 납부할 세액 조회에 나타나지 않을 수 있습니다. 부가가치세 신고내역 조회에서 접수 결과가 정상인지 먼저 봅니다.

조회 기간을 다시 확인합니다

납부내역이나 신고내역 조회는 기간 설정이 맞지 않으면 결과가 보이지 않을 수 있습니다. 신고월, 납부월, 과세기간이 서로 다르기 때문에 1개월만 보지 말고 3개월 또는 6개월 범위로 넓혀서 조회하는 것이 좋습니다.

예정고지인지 확정신고인지 구분합니다

개인 일반과세자는 4월과 10월에 예정고지 세액을 납부하는 경우가 있습니다. 이 경우 직접 신고한 부가세 확정신고 납부서와 메뉴가 다르게 느껴질 수 있습니다. 고지서가 온 경우에는 납부고지 내역 또는 전자고지 열람 메뉴도 함께 확인합니다.

전화·방문 문의가 필요한 경우

다음 상황에서는 홈택스 화면만 보고 판단하지 말고 관할 세무서나 국세상담센터에 확인하는 것이 안전합니다.

상황	문의할 곳
신고했는데 납부할 세액이 조회되지 않음	관할 세무서, 국세상담센터 126
카드 결제 오류가 반복됨	인터넷지로 상담센터, 카드사
납부 후에도 납부내역이 확인되지 않음	관할 세무서
예정고지 금액이 예상과 다름	관할 세무서
폐업 후 부가세 신고·납부가 헷갈림	관할 세무서 또는 세무대리인
납부기한 안에 납부가 어려움	관할 세무서, 홈택스 납부기한 연장 신청 메뉴 확인

세금은 사업장 규모, 과세유형, 폐업 여부, 고지 여부, 신고 시점에 따라 달라질 수 있습니다. 금액이 크거나 납부기한이 임박했다면 화면 캡처만 믿지 말고 공식기관에 확인하는 것이 안전합니다.

준비할 정보와 서류

부가세 납부 전에는 아래 정보를 준비해 두면 납부 과정이 빨라집니다.

준비 항목	필요한 이유
사업자등록번호	사업장 선택 및 납부서 확인
홈택스 로그인 수단	공동인증서, 금융인증서, 간편인증 등
부가세 신고 접수증	신고 정상 접수 확인
납부서	납부세액, 납부기한, 납부번호 확인
출금 계좌 또는 카드	계좌이체·카드납부 선택
카드 한도 정보	카드납부 전 한도 확인
납부확인서 저장 폴더	신고자료와 함께 보관

사장님이 자주 놓치는 부분

신고와 납부를 같은 의미로 보는 경우

부가세는 신고서 제출과 세금 납부가 나뉩니다. 납부할 세액이 있는데 신고만 하고 납부하지 않으면 납부지연 문제가 생길 수 있습니다.

납부기한 마지막 날 밤에 처리하는 경우

홈택스나 인터넷지로는 이용시간이 정해져 있고, 은행 계좌이체 가능 시간도 일부 제한될 수 있습니다. 마감일에는 접속자가 몰릴 수 있으므로 가능한 전날까지 납부를 끝내는 편이 안전합니다.

카드수수료를 비용으로 생각하지 않는 경우

카드납부는 편리하지만 납부대행수수료가 붙을 수 있습니다. 납부세액이 클수록 수수료도 커질 수 있으므로 최종 결제금액을 보고 선택해야 합니다.

납부확인서를 저장하지 않는 경우

납부가 끝난 뒤에는 납부확인서나 납부내역을 저장해 두는 것이 좋습니다. 세무대리인에게 자료를 전달하거나 다음 신고 때 기납부세액을 확인할 때 도움이 됩니다.

부가세 납부 전 체크리스트

아래 항목을 납부 전에 하나씩 확인해 보세요.

체크	확인 항목
□	부가세 신고 접수 결과가 정상인지 확인했다
□	사업자등록번호와 과세기간이 맞는지 확인했다
□	납부할 세액과 납부기한을 확인했다
□	납부서 또는 접수증을 저장했다
□	계좌이체, 카드납부, 간편결제 중 납부수단을 정했다
□	카드납부 시 납부대행수수료를 확인했다
□	카드 한도 또는 계좌 잔액을 확인했다
□	납부 완료 후 납부내역 조회를 했다
□	납부확인서 또는 납부내역을 저장했다
□	조회 오류나 금액 차이가 있으면 관할 세무서에 문의할 준비를 했다

예시로 보는 납부 흐름

예시 1. 개인 일반과세자 카페 사장님

카페를 운영하는 개인 일반과세자가 7월에 제1기 부가세 확정신고를 했습니다. 신고서 제출 후 납부할 세액이 확인되었다면, 홈택스에서 접수증과 납부서를 저장한 뒤 납부할 세액 조회/납부 메뉴에서 계좌이체 또는 카드납부를 선택합니다.

카드로 납부할 경우에는 납부세액 외에 납부대행수수료가 붙을 수 있으므로 최종 결제금액을 확인합니다. 납부 후에는 납부내역 조회에서 부가가치세 세목과 납부일자를 확인해 보관합니다.

예시 2. 간이과세자 소매점 사장님

간이과세자는 보통 다음 해 1월에 1년치 부가세를 신고합니다. 신고 결과 납부할 세액이 없다면 납부할 금액은 없을 수 있지만, 신고 접수증은 저장해 두는 것이 좋습니다. 납부할 세액이 있다면 홈택스 납부 메뉴에서 세목과 과세기간을 확인한 뒤 납부합니다.

예시 3. 폐업한 미용실 사장님

5월에 폐업했다면 다음 달 25일까지 폐업일까지의 부가세 신고·납부를 확인해야 합니다. 폐업신고만 했다고 끝난 것이 아니므로, 폐업 전 매출자료와 카드매출 입금내역, 세금계산서, 현금영수증 발행내역을 확인하고 납부서까지 저장하는 것이 좋습니다.

공식 사이트 링크 정리

부가세 납부 전에는 아래 공식 사이트에서 최신 메뉴와 신고·납부 기준을 확인하는 것이 안전합니다.

홈택스 바로가기

국세청 부가가치세 안내 바로가기

인터넷지로 바로가기

국세상담센터 바로가기

국가법령정보센터 바로가기

정부24 납부내역증명 민원 안내 바로가기

FAQ

Q1. 부가세 신고만 하면 납부도 자동으로 되나요?

아닙니다. 신고서 제출과 납부는 구분해서 확인해야 합니다. 납부할 세액이 있는 경우 홈택스 납부 메뉴에서 계좌이체, 카드납부, 간편결제 등으로 실제 납부까지 완료해야 합니다.

Q2. 홈택스에서 부가세 납부서가 안 보이면 어떻게 하나요?

먼저 신고내역 조회에서 신고가 정상 접수되었는지 확인합니다. 그다음 사업장 선택, 조회 기간, 과세기간을 다시 확인합니다. 그래도 조회되지 않으면 관할 세무서나 국세상담센터 126에 문의하는 것이 안전합니다.

Q3. 부가세를 신용카드로 납부할 수 있나요?

가능합니다. 다만 카드납부는 납부대행수수료가 붙을 수 있고, 해당 수수료는 납세자 부담으로 안내됩니다. 카드 한도, 수수료, 납부 완료 여부를 확인한 뒤 진행하는 것이 좋습니다.

Q4. 카드로 납부하면 세금이 줄어드나요?

아닙니다. 카드납부는 납부수단을 카드로 선택하는 것입니다. 부가세 납부세액 자체를 줄이는 방식이 아니며, 오히려 납부대행수수료가 추가될 수 있습니다.

Q5. 카드납부 후 승인 문자만 받으면 끝인가요?

승인 문자만으로 끝내지 말고 홈택스 또는 손택스 납부내역 조회에서 세목, 납부일자, 납부세액을 확인하는 것이 좋습니다. 필요하면 납부확인서나 납부내역증명을 저장해 두세요.

Q6. 부가세 납부기한을 넘기면 어떻게 되나요?

신고기한이나 납부기한을 넘기면 가산세가 적용될 수 있습니다. 금액이 크거나 납부가 어려운 경우에는 기한이 지나기 전 관할 세무서 또는 홈택스의 납부기한 연장 관련 메뉴를 확인하는 것이 좋습니다.

Q7. 인터넷지로와 홈택스 중 어디서 납부해야 하나요?

둘 다 국세 납부에 활용될 수 있습니다. 다만 신고 직후 납부서 확인과 납부할 세액 조회는 홈택스에서 먼저 확인하는 편이 흐름이 단순합니다. 카드납부나 지로 납부가 필요한 경우 인터넷지로를 함께 확인할 수 있습니다.

Q8. 세무대리인이 신고했는데 제가 직접 납부해도 되나요?

가능한 경우가 많지만, 납부서에 표시된 세액과 세목, 과세기간을 세무대리인에게 한 번 확인한 뒤 납부하는 것이 안전합니다. 신고서와 납부서 금액이 다르거나 예정고지와 확정신고가 섞여 있으면 착오가 생길 수 있습니다.

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마무리 요약

부가세 납부는 신고서를 제출한 뒤 납부할 세액과 납부기한을 다시 확인하는 단계입니다.
홈택스에서는 신고내역 조회에서 접수증과 납부서를 확인하고, 납부·고지·환급 메뉴에서 납부할 세액을 조회할 수 있습니다.

계좌이체로 납부하면 수수료 부담이 적고, 카드납부는 편리하지만 납부대행수수료와 카드 한도를 함께 확인해야 합니다. 인터넷지로를 이용할 때도 세목, 과세기간, 전자납부번호를 정확히 보고 진행하는 것이 좋습니다.

이 글은 소상공인과 개인사업자가 사업장 운영 중 참고할 수 있도록 공식기관 안내와 일반적인 적용 기준을 바탕으로 정리한 정보입니다. 세금 관련 사항은 사업장 규모, 과세유형, 신고 시점, 폐업 여부, 고지 여부에 따라 달라질 수 있으므로 실제 신고나 납부 전에는 홈택스, 국세청, 관할 세무서 또는 세무대리인에게 최신 기준을 확인해 주세요.